Сериал "Тайный советник" рассказывает историю Павла Костикова, опытного оперативника, чья карьера в убойном отделе резко обрывается. Во время задержания опасного преступника он получает тяжёлое ранение, а его напарник погибает. Вернувшись после реабилитации, Павел обнаруживает, что его перевели в аналитический отдел — решение, за которым стоит отец погибшего коллеги, генерал Смирнов, считающий Костикова отчасти виновным в трагедии.
На новом месте Павел чувствует себя чужаком, а груз вины становится только тяжелее. Особенно сложно ему рядом с вдовой напарника, адвокатом Полиной Смирновой, к которой он давно испытывает чувства. Когда Полина берётся за защиту клиента, обвинённого в убийстве, и уверена в его невиновности, её убеждённость заставляет Костикова действовать. Он начинает собственное, неофициальное расследование, рискуя и нарушая все правила.
Это расследование не только помогает оправдать невиновного и найти настоящего преступника, но и меняет всё. Полина начинает видеть в Павле не просто бывшего коллегу мужа, а ценного союзника. Так, исподволь, он превращается в её тайного советника, и их профессиональное сотрудничество постепенно перерастает в нечто гораздо большее, связывая их прошлое с новым, непростым будущим.